Согласно караимской традиции, великий князь литовский Витовт переселил 383 караимские семьи из Крыма в Тракай, позже — в Луцк и Галич после крымского похода в 1392/1397? году. Оттуда позднее караимы расселились по другим городам Литвы, Волыни и Подолии.

Караимы компактно проживают в некоторых местностях Литвы со времён средневековья. Караимы единственные из нехристиан в великом княжестве пользовались всеми выгодами Магдебургского права.
В современной Литве проживает менее 250 караимов в 3-х организованных общинах: Вильнюс (ок. 150 чел.), Тракай (менее 50 чел.), Паневежис (менее 30 человек). Имеются действующие караимские кенассы в Вильнюсе и Тракае (кенасса в Паневежисе была снесена в советское время), функционируют караимские кладбища (в Вильнюсе имеется общее татарско-караимское кладбище, разделенное, впрочем, на две части). В Тракае действует Караимский государственный этнографический музей. Время от времени издаются книги по караимской тематике на литовском языке или с параллельным текстом на литовском и караимском (латинской графикой) языках. Издан полный караимский молитвослов на караимском языке. Современная караимская община Литвы ведёт активную культурную и общественную работу.

Литовские татары (белорусские татары, липки) — самостоятельная этнотерриторальная общность татар.
Общая численность св. 26 тыс. чел. (1993), из них в Белоруссии свыше 10 тыс., Литве ок. 4 тыс. и Польше св. 5 тыс. чел. Языки в основном белорусский, литовский и польский. Письменность на основе кириллицы и латинской графики. Верующие в основном мусульмане-сунниты.

Сформировалась в конце XIV — начале XV веков на территории Великого княжества литовского из поступивших на службу к литовским князьям выходцев из Золотой Орды, позже из Большой и Ногайской Орд, Крымского ханства, в том числе потомков Мамая и его воинов (см. князья Глинские). В 1-й пол. XV века образовали васальное Литве княжество — Джаголдай.